มีข้อแตกต่างกันอยู่ 2 หลัก คือ
1.mysql_pconnect จะตรวจสอบก่อนทำการเชื่อมต่อฐานข้อมูลก่อนว่ามีการเชิ่อมต่อเดิมอยู่หรือไม่ ถ้ามีก็การเชื่อมต่อเดิมอยู่แล้วจะใช้การการเชื่อมต่อเดิมนั้นแทนโดยไม่ต้องเชื่อมต่อใหม่ทุกครั้งเหมือน mysql_connect
2. การเชิ่อมต่อไปยัง SQL server ด้วย mysql_pconnect จะไม่ปิดลงหลักจากสคริปสิ้นสุดการทำงานแล้ว แต่การเชิ่อมต่อนั้นจะยังคงเปิดไว้ใช้ต่อไป การปิดการเชื่อมต่อด้วย คำสั่ง mysql_close() จะใช้ไม่ได้กับการเชื่อมต่อแบบ mysql_pconnect แต่การเชื่อมต่อแบบ mysql_pconnect จะปิดลงเมื่อมีการปิดบราวเซอร์นั้นๆ ลง
หมายเหตุ
- การเชื่อมต่อแบบ mysql_pconnect ทำให้ไม่จำเป็นที่จะต้องเชื่อมต่อกับ SQL server ทุกครั้ง แต่ข้อเสียคือถ้ามีผู้ใช้จำนวนมาก อาจส่งผลต่อการเชื่อมต่อกับ SQL server ได้
